7月24日上午，挖掘機在事故現場掩埋車頭的照片和視頻在網上流傳，網絡輿論要求追查掩埋車頭的真相。當日凌晨，記者到達事故現場時，大批挖掘機和工程車進場。記者在現場也聽說，鐵路部門準備對車體破拆移走，預備恢復單向通車。中午前后，四五臺挖掘機在現場挖出一個大坑，將D301次動車車頭推入坑中。

　　據了解，溫州市政府反對在救援還在緊張進行時動用人力物力掩埋車頭。

　　26日下午，記者在事故現場看到，大批挖掘機在刨出土中掩埋的車頭殘骸。21時30分，殘骸全部被刨出，運往溫州鐵路南站附近的動車停車場。

　　對此，鐵道部門在接受記者采訪時說，在地方有關部門提出沒有發現生命跡象后，有的同志認為接下來應及時轉入工程搶險階段。當時現場的情況是，橋下場地狹窄，為了使事故處理場地的利用率更高，因此挖了一個幾米深的大坑，將車頭和損毀部件推入坑中，但沒有填土。